近年來，我國網絡技術的突破和計算機的廣泛運用，帶來了我國
人力資源管理系統的新升級，功能不僅從單一往全方面覆蓋發展，B/S的技術現已實現了跨時間、跨地域的操作，大大提升了人力資源管理系統的實用性。在這種技術升級的背景下，SaaS模式開始越來越頻繁地進入企業的視野。
然而，至今仍然存在很多人將SaaS型人力資源管理系統與個性化HR系統搞混，對于兩者之間的區別了解得并不充分。SaaS（Software-as-a-service）是軟件即服務的譯意，實際上就是一種軟件運營服務模式，與個性化的HR相比，其便捷性更符合當下企業選擇的主流趨勢。
下面本文將對二者的區別進行具體解析。
第一、開發周期不同。SaaS型人力資源管理系統主打“拆包即用”的便捷開發，企業只要向SaaS系統供應商支付資金領回相應賬號便通過網絡登陸相應的管理系統，實現應用。而個性化HR系統在系統正式上線之前需要供應商根據企業的需求進行一定的系統定制，也需要企業自身信息化技術進行一定升級后方可使用，開發周期較SaaS系統來得較長。第二、定制化程度不同。SaaS型人力資源管理系統的企業個性化定制程度比HR系統的低。這主要是開發周期、交付時間和便捷性需求的差異所決定的；如第一點所述，SaaS模式的突出性亮點在于便捷性，快速交付、快速上手應用。而定制化開發，能做出詳細的個性化定制修改，但相應的開發周期和部署時間過于長，投入成本較大。
這就足以嚇退大部分SaaS系統供應商，因此國內僅有HR系統供應商、極少數SaaS系統供應商如歡雀HR SaaS，支持企業個性化定制和本地部署。
第三、開發理念不同。傳統HR產品其關注的僅僅是HR事務本身的處理效率，而非連接人與工作目標。傳統HR不能在人和人、人和任務、人和信息之間建立高效連接，并記錄人的行為信息和價值貢獻，挖掘員工核心價值這一企業人力資源管理的根本目標，無法得到滿足。
畢竟，HR是PC環境下設計的產物，缺乏移動互聯網的場景化基因。也正因為這點多數高科技企業、外資企業等對SaaS系統的接受度都相應較高。
相比而言，SaaS系統的具體功能設計，更多以員工為中心的思想而設計，全員參與度高，構建企業人力資源管理的一站式解決方案。也因此，其是否能實際起作用還是取決于SaaS系統供應商，是否具備真正的人力資源管理基因、互聯網場景化基因，并很好的結合。光靠系統是不夠的，SaaS+線下服務，是未來的趨勢。
第四、使用風險、使用門檻不同。總體來說，HR系統（一）開發周期、實施周期較長、風險高，（二）對各種互聯網下開放接口的資源整合能力低，SaaS系統支持大多釘釘OA系統、企業微信、考勤機等某一項，當然兩項或以上集合對接的SaaS系統還是較少；（三）本地化部署，技術人員外地后期維護、軟硬件資源環境，系統總體擁有成本高，（四）產品升級維護成本高且具有風險，售后服務的相應效率相比較低。而SaaS較為便捷，快速上手，售后響應較為快速，產品迭代并滿足用戶的最新需求。
第五、收費不同。雖然SaaS系統和HR系統，都是按照企業選擇功能模塊的多少與服務時長來計算租賃費用。兩者都基本上涵蓋，員工管理、招聘管理、考勤排班、薪酬績效、流程審批、人才盤點、組織培訓等人力資源管理六大模塊常用模塊。
由于第四點中提到的各項原因，HR系統的收費總體上來說會比SaaS系統的高。因為相對于SaaS系統，HR系統更多地服務于大中型國有企業。綜上，對企業而言，并非一定要選擇特定的一種人力資源管理系統，而是需要根據企業自身的情況進行選擇，因為這個世上沒有最好的人力資源管理系統，只有最適合該企業的。
要是企業無法確定自己該如何選擇相應的系統，可通過專業的咨詢商獲取選型分析。
